另外，当前农机专业合作社还存在监管不到位的问题。由于监管机制不健全，一些合作社存在利用农机合作社名义从事非法经营的情况。这不仅损害了农机合作社的形象，也对农民的利益造成了损失。因此，加强合作社的监管和规范是当前亟待解决的问题。
此外，农机合作社在技术创新和信息化程度上仍有欠缺。当前农业生产已经进入了数字化、智能化时代，但是一些农机合作社在技术创新和信息化建设方面投入不足，无法适应农业现代化发展的需要。缺乏先进的技术和信息化手段，限制了农机合作社在提供高效农机服务方面的能力。
农机专业合作社在市场营销方面也存在一定问题。一些合作社对市场需求的了解不足，无法准确把握市场变化。同时，缺乏市场营销的有效手段和渠道，导致合作社的产品难以推广和销售。