技术难题是农业机械化面临的主要挑战之一。农业机械化需要先进的技术支持，包括机械设备的设计、制造、维修和管理等方面。但是，目前我国在农业机械化领域的技术水平相对较低，与发达国家相比仍存在着较大差距。因此，如何推动技术创新，提高农业机械化水平，是当前需要着重解决的问题。
农业机械化面临的挑战还包括资金和人才问题。农业机械化需要大量资金来投入机械设备的购买、更新和维护等方面。然而，我国农业机械化发展的资金来源相对有限，很难满足农民的需求。同时，农业机械化技术的推广普及需要大量的专业人才支持，但目前我国农业机械化领域的专业人才相对不足，人才培养体系还不完善，这也给农业机械化的推广带来了一定的困难。
另外，农业机械化在应用过程中还面临一些具体的挑战。农业生产环境复杂多变，不同地区、不同农作物的机械化需求不同，机械化设备的适应性和适用性有待进一步提高。此外，农民在使用农业机械化设备时需要具备一定的操作技能，但目前农民普遍的技术水平相对较低，因此如何提高农民的技术水平也是一个亟待解决的问题。