作物秸秆的含水量是导致脱粒机滚筒堵塞的常见原因之一。当作物的含水量过高时，秸秆会变得湿滑，容易黏附在滚筒上，导致滚筒无法有效地将作物从秸秆中分离出来。这时，滚筒容易被秸秆堵塞，影响脱粒机的正常工作。
作物的杂质含量也会引起脱粒机滚筒堵塞。作物在生长过程中，可能会掺杂着不同种类的杂质，如石块、土块、树枝等。这些杂质会与作物一起进入脱粒机滚筒，当滚筒与杂质接触时，杂质容易卡在滚筒上，导致堵塞的发生。
另外，脱粒机滚筒的设计和维护也是造成堵塞的重要原因之一。滚筒的设计不当，如滚筒的孔洞大小不合适、滚筒的压力不均匀等，都可能导致作物在脱粒过程中无法顺利通过滚筒。同时，滚筒的维护不到位，未能及时清理滚筒上的残留物，也容易造成滚筒的堵塞。
此外，操作不当和机器故障也会导致脱粒机滚筒堵塞。操作人员如果不熟悉脱粒机的工作原理和使用方法，可能会导致不正确的操作，如过度加速或减速、不及时清理滚筒等，从而引发滚筒堵塞。同时，机器故障，如滚筒轴承的损坏、滚筒链条的断裂等，也可能导致堵塞的发生。