对水田旋耕机的日常维护尤为重要。每次使用后，应及时清洗机具表面的泥土和残留物，避免积尘和腐蚀。同时，要检查传动部件的润滑情况，确保润滑油充足，及时添加或更换润滑油。此外，定期检查刀具的磨损情况，如有磨损需要及时更换，以保证耕作效果。
水田旋耕机的机具保养也要注意。在耕作操作过程中，应保持适当的行进速度和耕深，避免过度负荷和过度耕作。同时，要定期检查机具的各个部分，包括传动系统、刀具和曲轴等，如有松动或损坏需要及时调整或修复。此外，还应经常检查机具的作业质量，确保耕作质量达到预期效果。
水田旋耕机的存放和保养也不能忽视。在农闲期或长时间不使用时，应将机具存放在干燥通风的地方，远离水源和潮湿环境，避免生锈和腐蚀。同时，要定期检查机具的存放状态，如有发现问题应及时处理，避免损害机具造成不必要的损失。