智慧农机经营面临着技术难题。智慧农机需要依靠先进的技术来实现自动化、智能化的操作，但目前智慧农机的技术水平还不够成熟。智慧农机的传感器、控制系统等关键技术还存在一定的局限性，无法完全适应各种农田和作物的需求，导致操作效果不够理想。
智慧农机经营存在着高昂的成本问题。智慧农机的研发、生产和维护都需要大量资金支持，而目前市场上的智慧农机产品价格较高，农民难以承受这样的成本。此外，智慧农机的运营和维护也需要专业技术人员的支持，而农村地区缺乏这方面的人才，给智慧农机的推广和应用带来了困难。
智慧农机经营面临着安全隐患。智慧农机的自动化操作需要依赖网络和信息系统，这就增加了系统受到黑客攻击的风险。一旦智慧农机遭到黑客攻击，可能导致农机失控，对农田和作物造成损害。此外，智慧农机还存在着人员安全问题，例如操作人员对智慧农机的使用不当，可能造成意外伤害。
智慧农机经营还存在一定的法律和政策问题。当前，智慧农机的法律法规还不够健全，对智慧农机的监管和管理缺乏明确的规定。此外，智慧农机的应用还受到农田土地权属问题等政策限制，制约了智慧农机的推广和发展。