科学原则是农业机械安全监督管理的基础。科学原则要求依据科学技术水平和实际情况制定安全管理措施，以保障农业机械的安全运行。这包括对农业机械的设计、生产、使用和维护等环节进行科学规划和管理，确保农业机械的安全性能符合标准要求。
预防原则是农业机械安全监督管理的核心。预防原则要求在农业机械安全管理中，采取积极的预防措施，防范事故的发生。这包括从源头上控制和消除潜在的安全隐患，加强对农业机械的质量检测和监控，提高农民和农机操作人员的安全意识和操作技能，及时修缮和更换老化设备，以减少事故的发生。
公正原则是农业机械安全监督管理的基本要求。公正原则要求在农业机械安全管理中，坚持公正和公平的原则，依法行政，不偏私、不徇私，对农业机械的安全问题进行公正的审查和处理，确保农民和农机操作人员的合法权益得到保护。
此外，合理经济原则也是农业机械安全监督管理的重要原则。合理经济原则要求在农业机械安全管理中，合理利用资源，控制成本，并确保农业机械的安全性能符合经济效益要求。同时，还应采取措施促进农业机械的技术创新和升级，提高农业机械的安全性能和使用效率。