最佳插秧深度的选择应基于土壤类型和水稻品种。不同土壤类型具有不同的水分保持能力和通气性能，因此需要根据土壤类型确定最佳插秧深度。一般来说，对于黏土土壤，插秧深度应稍浅一些；对于砂质土壤，插秧深度应稍深一些。同时，不同的水稻品种对插秧深度也有一定的要求，有些品种对较深的插秧深度更适应，有些品种则对较浅的插秧深度更适应。
最佳插秧深度还应考虑水稻的生长特点和根系发育情况。水稻是浅根作物，根系主要分布在土壤表层，因此插秧深度过深会影响水稻的生长和根系发育。通常情况下，最佳插秧深度为5-7厘米，以保证水稻秧苗的顶芽能够正常出土并伸长，根系能够迅速生长并顺利吸收养分和水分。
最佳插秧深度的选择还应考虑气候条件和水田管理情况。在气温较高的地区，插秧深度可以稍深一些，以避免秧苗受到高温的伤害。而在气温较低的地区，插秧深度应稍浅一些，以利于秧苗的生长和根系发育。此外，插秧深度还应结合水田的施肥和水源情况进行调整，以保证水稻的养分供应和水分利用效率。