水堵可以防止水分进入发动机内部。在日常使用中，车辆经常会面临水上道路、雨天或者洗车时的水花溅湿发动机的情况。如果没有水堵的防护，这些水分可能会渗入发动机内部，导致发动机受潮。一旦发动机受潮，会导致发动机部分零部件生锈、腐蚀，甚至损坏。而水堵的存在，在一定程度上可以阻挡水分渗入发动机内部，保护发动机机体的完整性。
水堵还可以起到隔热的作用。在发动机运转时，会产生大量的热量。如果发动机表面有水分，水蒸气会吸热蒸发，形成蒸汽云雾，导致发动机周围空气湿度过高，从而影响发动机的散热效果。而水堵的存在可以有效减少水分蒸发，提高发动机周围环境的相对干燥程度，有利于发动机的散热，避免过热引起的故障。
此外，水堵还可以起到防尘的作用。道路上尘土飞扬，车辆行驶时会有大量的灰尘进入发动机机体内部。如果灰尘沉积在发动机零部件上，会影响机件的正常运转，甚至引起故障。而水堵可以形成一层保护膜，阻隔灰尘进入发动机机体，减少机件的磨损和损坏。