农业部是负责全国范围内农机行政执法的主要部门。农业部是国务院领导下的农业行政管理机构，承担着农业发展、农村经济建设的职责。在农机行政执法方面，农业部负责制定和颁布农机管理的相关政策、法规，并组织实施执法工作。此外，农业部还负责农机的标准制定、检测认证、产品质量监督等工作。
农村经济运行监测局也是农机行政执法的重要部门之一。农村经济运行监测局隶属于农业部，主要负责监测和分析农村经济运行情况，提供相关决策支持。在农机行政执法方面，农村经济运行监测局负责收集、整理和发布农机行业的运行数据，监测农机市场的价格、供应和需求情况，协助农业部制定农机管理政策。
此外，农村工作局也是农机行政执法的重要机关。农村工作局是国务院领导下的农村事务管理机构，负责协调和推进农村发展工作。在农机行政执法方面，农村工作局负责指导和监督农村地区的农机管理，加强农机维修和使用的培训，推动农机的科技进步和创新。