我们需要了解拖拉机质量问题的具体情况。如果拖拉机出现严重的质量问题，如发动机故障、传动系统故障等，制造厂决定更换整机，这意味着原有拖拉机的故障无法修复或修复成本过高。在这种情况下，由制造厂更换的整机应该经过严密的检验。这是因为拖拉机作为一种机械设备，如果质量问题没有得到有效解决，更换的整机很有可能存在隐患，可能会给农民的使用带来风险。
拖拉机更换整机后的检验应由专业的检测机构进行。这些机构应该具备相关的资质和能力，能够对拖拉机进行全面的检测，确保更换后的整机符合国家相关质量标准和技术要求。只有通过检验合格的拖拉机才能投入使用，以保障农民的安全和效益。
政府应加强对拖拉机质量问题的监管和管理。制定相关的法律法规，建立健全的质量检验制度，加强对拖拉机制造厂的监督和检查，严惩质量问题严重的企业。同时，加强对检测机构的认证和监管，确保其检测结果的真实性和公正性。