作业档位的选择应考虑到土壤类型和耕作深度。在水田中，土壤湿润度较高，如果选择过高的档位，容易导致旋耕机在耕作过程中产生较大的滑移现象，从而影响作业质量和效率。因此，一般建议选择较低的档位进行作业，以减少滑移现象的发生。
作业档位的选择还应考虑到耕作深度的要求。不同的耕作深度对于不同的作物有着不同的要求，因此需要根据具体情况来选择档位。一般来说，如果需要较浅的耕作深度，可以选择较高的档位，以提高作业效率。而如果需要较深的耕作深度，可以选择较低的档位，以增加旋耕机的切割力，确保耕作深度的达到要求。
作业档位的选择还应考虑到农机的性能和操作者的熟练程度。一般来说，手扶拖拉机的马力和转速较小，因此在选择作业档位时需要根据农机的性能来进行合理安排。同时，操作者的熟练程度也会影响作业档位的选择，熟练的操作者可以选择较高的档位进行作业，而对于新手来说，选择较低的档位进行作业可以降低操作难度，提高作业安全性。