清理水垢的方法主要有以下几种：
1.使用清洗剂：市面上有很多专门用于清洗发动机水路的清洗剂，可以依据说明书操作。首先需要将冷却液排放干净，然后将清洗剂倒入水箱内，启动发动机，让其自行循环20-30分钟，最后将清洗剂排出，用清水反复冲洗至水清为止即可。
2.使用机械清洗：机械清洗需要专业技师进行，使用高压水枪或者化学水浸泡的方式清洗水路管道和水泵等部件。这种方式清洗效果好，但需要花费较多费用。
3.使用酸性清洗剂：酸性清洗剂可以有效溶解水垢，但需要注意使用方法。首先需要将冷却液排放干净，然后将清洗剂倒入水箱内，启动发动机，在空档状态下加速至2000转，持续30分钟，然后将清洗剂排出，用清水反复冲洗至水清为止即可。