农用拖拉机在作业过程中常常出现发动机故障。发动机故障可能包括点火系统故障、供油系统故障、冷却系统故障等。点火系统故障可能导致发动机起动困难或者无法启动，供油系统故障可能导致发动机运行不稳定或者缺乏动力，冷却系统故障可能导致发动机过热。在作业前，应定期检查发动机的各个部件，确保其正常运行。
农用拖拉机在作业过程中还常常遇到传动系统故障。传动系统故障可能包括离合器故障、变速器故障、传动轴故障等。离合器故障可能导致拖拉机无法换挡或者换挡困难，变速器故障可能导致拖拉机无法正常变速，传动轴故障可能导致拖拉机无法正常传动动力。定期检查和维护传动系统的各个部件可以降低传动系统故障的发生率。
此外，农用拖拉机在作业时还可能出现液压系统故障。液压系统故障可能包括液压油泄漏、液压油温过高、液压缸漏油等。液压油泄漏可能导致液压系统无法正常工作，液压油温过高可能导致液压系统损坏，液压缸漏油可能导致液压系统无法正常执行作业任务。定期检查液压系统的各个部件，并及时更换液压油和维修液压缸等部件，可以减少液压系统故障的发生。