生物燃料是一种已经广泛应用于交通领域的新型发动机燃料。生物燃料主要包括生物柴油和生物乙醇。生物柴油是由生物质资源如植物油、动物脂肪等经过酯化反应得到的一种燃料，它具有良好的可再生性和低碳排放的特点。生物乙醇是通过植物中的糖分经过发酵过程得到的一种燃料，其燃烧产生的二氧化碳量与植物吸收的二氧化碳量相平衡，具有较低的温室气体排放量。
氢燃料是另一种已经成熟并得到实际应用的新型发动机燃料。氢燃料是通过水电解、天然气重整、生物质气化等方式获得的，它的燃烧产物仅为水蒸气，几乎没有污染物的排放。氢燃料具有高能量密度、快速加注、零排放等优点，被视为未来替代传统燃料的重要选择。
此外，甲醇和天然气也是已经成熟并得到实际应用的新型发动机燃料。甲醇是一种由天然气、煤炭等资源制取的液态燃料，其燃烧产生的碳排放量较低。天然气是一种主要成分为甲烷的烃类气体，它的燃烧产生的二氧化碳和颗粒物排放量较低，也是一种清洁燃料。