磨合是指在机器投入使用前一段时间内，逐渐使各运动副之间形成更好的配合，达到理想的工作状态。对于拖拉机柴油机来说，磨合期一般在50到100小时之间。这个时间段足够长，可以确保柴油机的各个零部件得到充分磨合，同时又不会过长，造成农业生产的延误。
在柴油机的磨合期，需要注意以下几个方面。首先，要严格按照使用说明书上的要求进行操作。这包括启动、加速和怠速等方面的注意事项。柴油机在磨合期内，转速不宜过高，不宜长时间高负荷工作，以避免引起过早磨损或损坏。
要定期更换机油和机滤。在磨合期内，柴油机的机油容易产生金属颗粒和磨屑，及时更换机油和机滤可以有效减少对发动机的损伤。通常建议在前50小时内更换一次机油和机滤，之后每200小时更换一次。
此外，还要注意保持柴油机的冷却系统和燃油系统的正常工作。冷却系统的温度过高或过低，都会影响柴油机的正常工作。燃油系统的清洁也是很重要的，避免杂质进入燃油系统，造成堵塞或磨损。
要定期检查和紧固柴油机的各个零部件。磨合期内，由于机器和零部件之间的磨擦，有可能会导致松动。因此，及时检查和紧固这些零部件，可以防止进一步的损坏。