根据我国现行的高速公路收费政策，车辆过高速公路需要缴纳相应的收费。联合收割机作为一种特殊的运输工具，其巨大的体积和重量无疑会对高速公路的路面造成一定的压力和磨损。因此，按照公平原则，运输跨区作业的联合收割机的车辆应当被视为一种特殊车辆，需要缴纳相应的高速收费。
联合收割机运输车辆的特殊性也需要考虑。一台联合收割机的体积通常较大，其超宽和超高的特点会给行车带来一定的安全隐患。而高速公路通常设有限高桩，用于限制过高的车辆进入。因此，运输跨区作业的联合收割机的车辆过高速收费，可以视为一种监管措施，以确保道路交通的安全和顺畅。
然而，也有人认为运输跨区作业的联合收割机的车辆不应缴纳高速收费。他们认为，联合收割机的运输过程中，往往是在夜间或交通量较少的时段进行，对高速公路的交通流量影响较小。此外，联合收割机的运输通常是为了农业生产服务，对农民来说已经是一项巨大的投入成本。如果再加上高速收费，将给农民造成更大的经济负担。