燃油净化的基本流程是：过滤、分离、处理。这三个环节缺一不可，它们共同构成了燃油净化的过程。
过滤是燃油净化的第一步，是将油中的杂质、颗粒物等物质筛选出来的过程。过滤的方式有多种，如机械过滤、离心过滤、电子过滤等，其中机械过滤最为常见。机械过滤器可以在燃油进入柴油机之前将其中的杂质、颗粒物等物质过滤掉，保证柴油机的正常运转。
分离是燃油净化的第二步，是将油中水分、沉淀物等物质分离出来的过程。分离的方式有多种，如离心分离、重力分离、沉淀分离等，其中离心分离最为常见。离心分离器可以将油中的水分、沉淀物分离出来，保证柴油机的正常运转。
处理是燃油净化的第三步，是将油中的化学物质、异物等物质处理掉的过程。处理的方式有多种，如化学处理、物理处理、生物处理等，其中化学处理最为常见。化学处理剂可以将油中的化学物质、异物处理掉，保证柴油机的正常运转。