农机合作社的组织管理问题。农机合作社的组织结构需要合理设置，要根据合作社规模和业务范围确定相应的职能部门和管理人员。同时，还需要建立科学的决策机制，明确决策权力和责任，避免决策集中或者决策分散的问题。
农机合作社的财务管理问题。农机合作社作为一个经济组织，必须建立健全的财务管理制度，包括会计核算、财务报告和内部控制等方面。同时，还要加强对资金使用的监督和管理，确保合作社的资金安全和合理使用。
农机合作社的设备管理问题。农机合作社的设备是合作社正常运行的基础，因此需要建立完善的设备管理制度。首先，要加强设备的保养和维修工作，确保设备的正常运转。其次，要合理安排设备的使用计划，提高设备的利用率。最后，要加强设备的更新和升级，以满足农业生产的需求。
农机合作社的人员管理问题。农机合作社需要建立一支专业化的人才队伍，包括农机操作员、技术人员和管理人员等。因此，合作社应该加强对人员的培训和岗位培养，提高人员的素质和业务能力。同时，还要建立激励机制，激发人员的积极性和创造性，提高工作效率。
农机合作社的监督管理问题。农机合作社需要建立健全的监督管理机制，包括内部监督和外部监督。内部监督是指合作社内部成员对合作社的管理行为进行监督，外部监督是指政府和农业部门对合作社的管理行为进行监督。通过建立有效的监督机制，可以避免合作社管理不规范和违法违纪行为的发生。