分离装置一般由凹凸槽和风选装置组成。在收割作业中，全喂入式联合收割机将庄稼整株连根割取，然后将其送入分离装置。凹凸槽是分离装置中的主要部分，其表面上有许多凸起的突起，庄稼被送入凹凸槽后，受到突起的摩擦和撞击，使得庄稼的籽粒与秸秆分离开来。凹凸槽的设计和调整能够根据不同庄稼的特性进行灵活的调整，从而适应不同作物的收割需求。
分离装置的另一个重要部分是风选装置。在庄稼经过凹凸槽后，籽粒和秸秆混合在一起，通过风选装置可以有效地将它们分离开来。风选装置利用了颗粒的重量和轻重差异，通过调节风的速度和方向，将轻的秸秆吹走，而重的籽粒则被保留下来。这样可以确保收割机所收割的庄稼只包含了有价值的籽粒，而且还能减少庄稼中的杂质，提高收割的质量。