农机深松作业的最佳时间是在农作物生长期结束后。深松作业会对农作物的根系造成一定的伤害，因此在农作物生长期进行深松作业可能会影响作物的生长和发育。一般来说，在农作物收获后，土壤中的杂草和残留根系会逐渐凋零，此时进行农机深松作业，可以有效地清除土壤中的残留根系和杂草，为下一季作物的种植创造良好的土壤环境。
农机深松作业的实施时间还要考虑气候条件。一般来说，气温较高、降雨较少的季节是农机深松作业的最佳时间。在这样的气候条件下，土壤中的水分蒸发较快，可以避免深松后土壤过于潮湿，导致土壤结构破坏。此外，降雨较少也可以减少农机在作业过程中受到的干扰，提高工作效率。
农机深松作业的实施时间还要根据具体的农作物种类和生长特点来确定。不同的农作物对土壤的要求不同，因此实施农机深松作业的时间也有所差异。一般来说，对于一些根系发达、对土壤要求较高的作物，如玉米、大豆等，深松作业可以在收获后的几天内进行；而对于一些根系较浅、对土壤要求不高的作物，如小麦、水稻等，可以在收获后的几周内进行农机深松作业。