水稻的根系是以须根系分布在土壤耕作层的上中层土壤内。
水稻根系的分布，在不同生育时期不同。在分蘖期，一级根大量发生，但分布较浅，多数在0～20厘米土层内横向扩展呈扁椭圆形；在拔节期，分枝根大量发生，并向纵深发展，至抽穗期，根系转变为倒卵圆形，横向幅度达40厘米，深度达50厘米以上；在开花期，根部不再继续伸展，活动能力逐渐减退；接近成熟期时，根系吸收养分的能力几乎完全停止，这时所需的养分全靠植株体内的养分转移维持。从总体上看，水稻根系主要分布在0～20厘米土层中，约占总根量的90%。从全生育期看，水稻在抽穗期根量达最大值。