田间发现有条锈病为害时，要及时采取发现一点打一片，发现多片全田打药的策略。一般喷药越早，防治效果越好。发生较重或雨日天气多要连喷2-3次，七天一次，发病中心及其植株要重点喷施，药剂可以亩用12.5%氟环唑50-60毫升，拿敌稳20克。
小麦锈病药物防治：每亩用15%粉锈宁可湿性粉剂50克或20%粉锈宁乳油每亩40毫升，或25%粉锈宁可湿性粉剂每亩30克，或12.5%速保利可湿性粉剂每亩用药15～30克，对水50～70公斤喷雾，或对水10～15公斤进行低容量喷雾。
采取绿色防控与化学防治相结合，应急处置与持续治理相结合，专业化统防统治与群防群治相结合的防控策略，抓住重点地区、重大病虫、关键时期，实施科学防控，注重用药安全，推广绿色防控，实现农药减量控害。
药剂拌种。小麦播前选用种子量0.2%的3%苯醚甲环唑悬浮种衣剂，或种子量0.06%的6%戊唑醇悬浮种衣剂拌种包衣，兼治小麦腥黑穗病、白粉病、锈病等病害。
小麦锈病的防治措施：（1）农业防治。①因地制宜，种植抗病品种，尤其要选择抗条锈和叶锈的小麦品种，并注意抗病品种的合理布局和轮换。②在锈菌的越夏基地麦收后及时翻耕灭茬，消灭自生麦苗，减少越夏菌源，也可减轻小麦锈病的发生。③冬麦播种不要太早；采用配方施肥，勿偏施氮肥；及时浇水，以补充因孢子堆表皮破裂而损失的水分。（2）药剂防治。②叶面喷雾。