主要病源是黄瓜花叶病毒和烟草花叶病毒。黄瓜花叶病毒主要在多年生杂草及保护地蔬菜上越冬，第二年由蚜虫传播。烟草花叶病毒在土壤、病残体、种子或卷烟中越冬，主要通过田间农事操作由汁液接触传播。高温干旱天气有利于蚜虫繁殖和传毒，重茬、缺水、缺肥、管理粗放、苗小、定植晚易引起该病流行。辣椒病毒病分为很多种类，条斑病毒病便是其中一种，防治难度大于花叶病毒病，可以侵染果实、茎秆，有时与花叶病毒病混发，在叶片同时表现出花叶。如果只发生条斑病毒病，很少侵染叶片，很多菜农对果实发病症状分辨不清，误以为是细菌性病害。
