晚疫病是番茄主要病害之一，会带来毁灭性危害，应注意防治。预防要重于治疗，防治晚疫病是一个系统工程，从品种选择到育苗定植，从栽培管理到环境控制都要把关。选用抗病品种，科学合理栽植，采用健康壮苗。发病前用代森锰锌，丙森锌等药剂进行预防，发病初期用霜脲氰，烯酰玛琳等药剂进行防治。发病时用药，喷施杜邦福星乳油或杜邦克露可湿性粉剂等。
防治方法包括清洁田园，彻底清除病株、病果，减少初侵染源。经常检查植株下部靠近地面的叶片，一旦发现中心病株，立即除去病叶、病枝、病果或整个病株，在远离田块的地方深埋或烧毁，同时立即施杀菌农药和连续消毒，防止病害蔓延。避免在有番茄晚疫病的棚内育苗，定植前仔细检查剔除病株，并喷1次药。雨季及时排涝，降低田间湿度。
生物防治也是重要措施，发病初期适当控制浇水，保护地栽培注意增强通风，降低空气湿度。培育无病壮苗，增施有机底肥，注意氮、磷、钾肥合理搭配。收获后彻底清除病株落叶。