玉米粗缩病的症状，从外观看，最直接的是矮化，和正常的玉米植株有明显的差距，不足一半。凑近仔细看的话，叶片还会有白色的条状突起，用手摸的话，有一种粗糙不平的感觉。玉米粗缩病患病较轻的话，导致的后果为：雄穗发育不良、散粉少，雌穗短、花丝少、结实少。
1、病株生长受到抑制，平均身高却只有几十厘米，节间粗肿缩短，严重矮化。2、病株根系少而短，不及健株的一半，易从土中拔起。3、病株光长叶子不拔节，叶片密集丛生，又短又尖。4、叶片上原本清晰平滑的叶脉也会变得断断续续、杂乱无章。随着病情发展，植株的叶背、叶鞘上的叶脉还会出现明显的条状突起。5、轻病株雄穗发育不良、散粉少，雌穗短、花丝少、结实少。重病株雄穗不能抽出，或者虽能抽出但分枝极少、无花粉，雌穗畸形不实或籽粒很少。
玉米整个生育期都可感染发病，以苗期受害最重，病株明显矮化，高度不到健株的1/2，叶色深绿，宽短质硬，呈对生状，叶背面侧脉上现蜡白色突起物，粗糙明显。病株分蘖多，根系不发达，易拔出。多数不能抽穗结实，个别雄穗虽能抽出，但分枝极少，没有花粉。
对于玉米来说，整个生长期，其都有可能染上粗缩病，而其中，如果玉米在幼苗期染上粗缩病，其的发病症状更为严重。在5～6叶期，玉米就会展现出发病的症状，而到9～10叶期，就会产生矮化现象，并且更加明显，在发病期间，玉米不能抽穗结实，雄蕊和雌蕊相对于正常玉米来说也更加畸形，而植物结果是需要正常的雄蕊和雌蕊的，雄蕊和雌蕊地畸形就会严重影响到植物的繁殖，因此就会出现玉米无法结出果实情况的发生。这也就是玉米一旦染上粗缩病而导致减产的原因。