小麦属于须根系，由初生根和次生根组成。初生根是直接生长在小麦种子上的根、次生根是生长在小麦分蘖节上的根。
初生根、次生根及其分枝根构成小麦的根系。初生根扎根集中、生长迅速，到分蘖期，其长度可达50-60厘米。初生根的人土深度也较深，冬小麦可达3米以下，春小麦达1.5-2米。
1.初生根：又称胚根或种子根，当种子萌发时，种子胚部的主胚根首先突破种皮，长了出来，然后两侧陆续长出几条侧根，这些根统称为初生根。2.次生根：小麦的次生根多从分穗穗节上长出，小麦在三叶期以后开始形成分株，分蘖与次生根有一定的必然联系，但也不存在绝对固定的关系，迟发的分枝梗往往没有自己的次生根，而必需依靠主茎或大分蘖来供给水分和养分，这是小分蘖容易死亡的一个重要原因。
初生根又叫种子根，2到3条，功能伴随小麦一生，扎根深度可达一米以上，次生根长在蘖节上。