鲜黄色、红褐色或褐色的夏孢子堆，后期病部生成黑色的孢子堆。
小麦叶锈病主要危害小麦叶片，产生疱疹状病斑，很少危害叶鞘和茎秆。叶片受害，产生圆形或近圆形橘红色疹状病斑，即夏孢子堆。夏孢子堆比秆锈病的小，较条锈病的大。夏孢子堆表皮破裂后，散出黄褐色粉末，即夏孢子。夏孢子堆较小，不规则散生，多发生在叶片正面。有时病菌可穿透叶片，在叶片两面同时形成夏孢子堆。后期在叶背面散生暗褐色至深褐色、椭圆形的冬孢子堆，成熟时不破裂。有时也为害叶鞘，但很少为害茎秆或穗。
初起是在麦叶和麦秆的表面出现绿色的斑点，以后长出红褐色的夏孢子堆，最后形成黑色的疮斑。冬孢子堆主要发生在叶背面和叶鞘上。夏孢子堆较小，橙褐色，圆形至长椭圆，不规则散生。冬孢子堆长椭圆形，散生，埋于表皮下。
小麦叶锈病主要危害小麦叶片，很少危害叶鞘和茎秆。叶片受害，产生圆形或近圆形橘红色疹状病斑，有时病菌可穿透叶片，在叶片两面同时形成夏孢子堆。后期在叶背面散生暗褐色至深褐色、椭圆形的冬孢子堆，成熟时不破裂。有时也为害叶鞘，但很少为害茎秆或穗。