水稻叶瘟的症状是出现急性型病斑和慢性型病斑。一般急性型病斑呈暗绿色椭圆形水渍状，上面有浓密的灰色霉块，传染快，在环境改变时会转为慢性型病斑。慢性型病斑呈褐色纺锤形，外围呈黄色，中层呈红褐色，中间呈灰白色，病斑大小不一，但形状基本一致。
水稻叶瘟有几种类型：急性型：病斑较小、不规则、暗绿色、水渍状，斑上密生灰绿色霉层，感病品种在高温高湿时易形成此型病斑；慢性型：病斑梭形，外围有黄色晕圈，内部褐色，中央灰白色，并有褐色坏死线贯穿病斑并向二梭尖端外延伸。潮湿时，病部也长灰绿色霉层；白点型：病叶上形成近圆形白色小斑点，多在干燥及温度稍低时形成；褐点型：病叶上形成褐色小斑点，局限于叶脉间，常出现在抗病品种及老叶上。