主要危害叶片和果实。叶片上病斑近圆形或呈放射状，初期叶上生绿褐色霉层，稍后霉层渐变为褐色至黑色。严重时病斑布满全叶，叶片枯焦，易早期脱落。叶柄、叶脉及果实等上的症状都与梨黑星病相似，特点是后期在病斑上均覆盖一层黑霉（即病菌的分生孢子梗和分生孢子）。
叶片染病：初现黄绿色圆形或放射状病斑，后变为褐色至黑色，边缘明显，向叶正面隆起呈泡斑，表面生浅褐色绒状霉层，感病严重时叶片变小变厚，呈卷曲或扭曲状，病斑相互愈合呈大斑，病部干枯破裂。会造成果树早期落叶，并影响花芽分化和树势。果实染病：初生淡绿色斑点，圆形或椭圆形，渐变褐色至黑色，表面也产生黑色绒状霉层，随果实膨大，病斑逐渐凹陷，硬化，常发生星状开裂。这将会直接影响苹果的产量和质量。
苹果黑星病主要危害叶片和果实。叶片上病斑近圆形或呈放射状，初期叶上生绿褐色霉层，稍后霉层渐变为褐色至黑色。严重时病斑布满全叶，叶片枯焦，易早期脱落。果实发病，幼果和成熟果都可受侵害，病斑初为淡黄绿色，圆形，后期褐色或黑色，表面有绒状霉层，病斑凹陷，硬化龟裂。