可以采用农业和化学措施来进行防治。在播种前使用粉锈宁进行拌种，并合理施用磷钾肥，提高植株抗病力，在发病后使用等喷雾防治。
1、选择优良抗病品种。2、用井冈霉素进行防治。
选择抗病品种，合理肥水管理，合理密植，综合防治病虫草害。
1、加强管理。结合春季小麦田间管理，清沟理墒，降低田间湿度；及时防除杂草，改善通风透光条件，注意拔节后不能再喷除草剂，否则必定遭受药害；防止重施、偏施氮肥。2、适期防治。防治小麦纹枯病，应掌握在小麦拔节前后、纹枯病初发时用药（3月中旬左右）。
首先是选种抗病品种，其次是在小麦苗期发病时，用井冈霉素等药剂防治。