菌核病是土传病害，侵染茎基部，菌丝体缠绕凝结成菌核状。
主要为害果实及茎蔓。果实染病，残花部先呈水浸状腐烂，后长出白色菌丝，菌丝上散生鼠粪状黑色菌核。茎蔓染病，初呈水浸状，病部变褐，后也长出白色菌丝和黑色菌核，病部以上叶、茎蔓枯死。菌核病是土传真菌性病害,常造成植株枯死或腐烂。其寄主十分广泛,可侵害64科383种植物,蔬菜作物包括西葫芦、番茄、茄子、甜椒、菜豆、莴笋、白菜、黄瓜等,是保护地蔬菜主要病害之一。一般受害的地块产量损失10%～30%,重者达90%以上。
危害叶，茎及果实。幼叶初现水浸状污点，后扩大褐色或墨色斑，易穿孔。茎上现椭圆形或纵长凹陷黑斑，中部易龟裂。幼果初生暗绿色凹陷斑，后发育受阻呈畸形。果实病斑多疮痂状，有的龟裂或烂成孔，病斑分泌出半透明胶状物，后变琥伯色块状。湿度大时，上述各病斑表面密生煤色霉层。
主要为害果实及茎蔓。果实染病，残花部先呈水浸状腐烂，后长出白色菌丝，菌丝上散生鼠粪状黑色菌核。茎蔓染病，初呈水浸状，病部变褐，后也长出白色菌丝和黑色菌核，病部以上叶、茎蔓枯死。