保护的重点时期要放在春季，即在发病初期就把病情控制住，以免让病害大量发生后难于防治。使用药剂以15%三唑酮1000～1500倍液、70%甲基硫菌灵（甲基托布津）1000倍液（50%甲基托布津800倍液）的防治效果最好，同时具有保护和治疗作用。其次有40%福美胂500倍液、波美0.3～0.5度石硫合剂。0.4%氯苯嘧啶醇、乐杀螨、嗪氨灵及0.1%双苯三唑醇等药剂的防治效果也很高。具体喷药时间可放在花前、70%落花以及10天以后喷布3次；其后再根据病情发展酌情考虑喷药。砧苗可在发病初期连续喷药2～3次。
农业防治：选用抗病品种，合理密植。冬春剪除病梢、病芽，集中烧毁或深埋，减少越冬菌源。早春发芽后经常注意观察，及时剪除病梢、病芽。推广配方施肥技术，增施有机肥，避免偏施氮肥；适当稀植，控制灌水；及时疏除过密枝组。（2）药剂防治：发芽前喷洒硫黄；春季于发病初期喷施三唑酮、丙环唑或乐必耕等。对上述杀菌剂产生抗药性的地区可选用腈菌唑、氟硅唑、特富灵或戊唑醇。10～20天1次，连防3～4次。在苗圃中，幼苗发病初期，可以连续喷2～3次石硫合剂，或甲基硫菌灵，或晶体石硫合剂。（3）生物防治：用农抗120防治白粉病，在发病初期，进行喷雾防治，过15～20天再喷1次，如果病情严重，可缩短喷药时间的间隔期。
苹果树白粉病防治可以喷施三唑酮，甲基托布津进行防治。