发病初期可用50%速克灵可湿性粉剂1000倍液,或50%腐霉利可湿性粉剂1000倍液,或50%乙烯菌核刊可湿性粉剂1000倍液,或50%异菌脲可湿性粉剂1000倍液,或40%菌核净可湿性粉剂1000倍液,或50%氯硝铵可湿性粉剂1000倍液,或40%灭病威可湿性粉剂500倍液,或20%甲基立枯磷可湿性粉剂1000倍液等药剂喷雾,每7天1次,连续防治2~3次,重点喷植株基部。大葱菌核病和大蒜菌核病可用速克灵可湿性粉剂喷雾防治,效果较好。可用咪鲜胺、多菌灵、腐霉利、菌核净、异菌脲、啶菌恶唑喷雾防治。用50%扑海因1000倍液、70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液、40%菌核净可湿性粉剂1000倍液、65%甲霉灵1000~1500倍液等喷灌植株基部,每7~10天1次,连喷2~3次。各种药剂轮换使用效果更佳。选用抗性良种,用速克灵/菌核净交替喷雾使用。发病初期选用50%托布津500~800倍液喷雾,或用50%达克灵可湿性粉剂1000倍液喷雾,每10~15天喷一次,连续喷2~3次,便能控制病害蔓延。喷雾重点部位是植株中、下部及地面。