导致玉米苗发紫的原因有：1、缺磷。这个也是最重要的因素，一般情况下，就是土壤中缺磷导致的，缺磷后，玉米正常的代谢就会收到影响，导致叶片中的糖分分解过慢，逐渐积累，导致叶片发红发紫。2、土壤板结。土壤板结、田间积水等，会导致根系不发达，经过观察发现，紫苗在低温、板结和排水不良的地块上出现的较多。3、干旱或低温。这两种原因都可以导致玉米根系生长缓慢，对磷的吸收能力减弱，导致出现发紫的现象。
土壤板结，干旱或低温都会影响植物对磷的吸收，从而表现出缺磷症状，即玉米苗发紫。
地温低或者土壤缺磷，可以喷施磷酸二氢钾缓解。