胡萝卜黑腐病的发病原因可能与肥水管理不当有关。
高湿利于发病，生长期间多雨，土壤潮湿黑腐多；贮运期间湿度大腐烂严重。肉质根膨大期，地下害虫为害严重，造成的伤口多，易发病。
苗期侵染可导致未出土胡萝卜幼苗或苗期幼苗猝倒；成株老叶易感病，发病时首先在叶柄上形成黑色斑点，后扩展到叶梢，导致整片叶枯死，发病严重时扩展到胡萝卜根冠部，形成一个黑色腐烂环（即黑冠）；贮藏期胡萝卜侵染后会出现干燥的黑色内陷病灶，在温暖潮湿贮存条件下，病原菌在胡萝卜间迅速蔓延。
胡萝卜黑腐病的原因：苗期侵染可导致未出土胡萝卜幼苗或苗期幼苗猝倒；成株老叶易感病，发病时首先在叶柄上形成黑色斑点，后扩展到叶梢，导致整片叶枯死，发病严重时扩展到胡萝卜根冠部，形成一个黑色腐烂环（即黑冠）；贮藏期胡萝卜侵染后会出现干燥的黑色内陷病灶，在温暖潮湿贮存条件下，病原菌在胡萝卜间迅速蔓延。
胡萝卜黑腐病的发病原因：苗期侵染可导致未出土胡萝卜幼苗或苗期幼苗猝倒；成株老叶易感病，发病时首先在叶柄上形成黑色斑点，后扩展到叶梢，导致整片叶枯死，发病严重时扩展到胡萝卜根冠部，形成一个黑色腐烂环（即黑冠）；贮藏期胡萝卜侵染后会出现干燥的黑色内陷病灶，在温暖潮湿贮存条件下，病原菌在胡萝卜间迅速蔓延。
首先可能是由于种子原因，种子自身携带了真菌病毒，在出苗之后开始发病，导致产生。在出苗期时感染会导致还没有出土的幼苗发生猝倒。成熟期的老叶也比较容易发病，在叶柄上形成一个个黑色的小斑点，然后会一直扩散到整片叶子，导致叶子全部枯死。严重的时候会一直发展到胡萝卜的头部，腐烂成黑色。贮藏环境太过于潮湿也会引发。