一是早稻选用抗病品种。二是合理配方施肥，防止后期早衰。适当增施钾肥。三是开深沟，浅水勤灌，适时晒田，使水稻生长健壮，提高抗病能力。四是药剂防治：应在水稻始抽穗时（抽穗5至10%），喷洒50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液，此外每亩可选用50%多菌灵60克，加5%井冈霉素80毫升，兑水65至70公斤混合喷洒防效80%以上。
选种抗耐病品种，合理稀植，平衡施肥，加强水层管理，适时施药防治。
水稻紫鞘病主要发生在水稻抽穗后，会导致水稻减产，因此要预防该类病害，宜选用抗病品种，并合理配方施肥，促进植株抗病能力。在水稻开始抽穗时，可以选用苯菌灵可湿性粉剂或多菌灵、井冈霉素等药剂进行喷施防治。