西瓜病毒病有花叶型和蕨叶型两种。发生花叶型病毒后，新叶首先表现出明显的褪绿斑点，进而在叶片上到处都有浓绿色和淡绿色相间镶嵌花斑，节间缩短，植株矮化，结果少而小。发生蕨叶型病毒病时，新叶狭长，皱缩扭曲，花器不发育难以坐瓜。
危害症状。西瓜病毒在田间主要表现为花叶型和蕨叶型两种症状。花叶型：初期顶部叶片出现黄绿镶嵌花纹，以后变为皱缩畸形，叶片变小，叶面凹凸不平，新生茎蔓节间缩短，纤细扭曲，座果少或不座果。蕨叶型：新生叶片变为狭长，皱缩扭曲，生长缓慢，植株矮化，有时顶部表现簇生不长，花器发育不良，严重的不能座果。发病较晚的病株，果实发育不良，形成畸形瓜，也有的果面凹凸不平，果小，瓜瓤暗褐色，对产量和质量影响很大。