辣椒软腐病的防治措施包括：实行与非茄科及十字花科蔬菜进行2年以上轮作；及时清洁田园，将病果清除带出田外烧毁或深埋；培育壮苗，适时定植，合理密植；雨季及时排水，防止积水；保护地栽培要加强放风，控制棚内湿度；及时喷洒杀虫剂防治烟青虫等蛀果害虫；药剂防治，可选用72%农用链霉素可溶性粉剂4000倍液、新植霉素4000倍液、50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液、77%氢氧化铜可湿性微粒粉剂500倍液、14%络氨铜水剂300倍液等药剂进行喷洒。此外，发病初期可喷洒72％硫酸链霉素可湿性粉剂3000倍液，以及使用1.8%阿维菌素防治害虫，缓解病情。
