发病初期可用代森锰锌、氢氧化铜、苯醚甲环唑、甲基硫菌灵、杀毒矾、多菌灵、加瑞农喷雾防治，每隔5-7天防治，连续防治3-4次。保护每亩可用百菌清进行防治，每隔10天防治一次，连续2-3次。
加强农业防治，芹菜种子用48℃的温水浸泡30分钟，捞出后浸入冷水散热，捞出种子后就可播种。
预防该病应在芹菜苗高3cm时就开始进行喷药保护，每隔7-10d喷1次，连喷2-3次。大棚发病期可用45%百菌清烟雾剂，每亩200-250g熏烟，或用5%百菌清粉剂，每亩1000g喷粉，施药方便，又可降低棚内湿度。喷粉药剂还可选用70%代森锰锌可湿性粉剂、58%瑞毒锰锌可湿性粉剂、64%杀毒矾可湿性粉剂、75%百菌清可湿性粉剂、50%多菌灵可湿性粉剂等。