防治。种植耐病品种。增施腐熟有机肥，实行稻麦轮作或与棉花、烟草、蔬菜等非寄主作物轮作。
轮作倒茬。实行稻麦轮作或与棉花、烟草、蔬菜等经济作物轮作，也可改种大豆、油菜、马铃薯等，可明显降低发病。种植耐病品种。如烟农15号、济南13号、济宁3号等。增施腐熟有机肥。
防治方法。1、因地制宜地选用适合当地栽培的抗根腐病的品种，种植不带黑胚的种子。2、提倡施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟的有机肥。麦收后及时耕翻灭茬，使病残组织当年腐烂，以减少下年初侵染源。3、采用小麦与豆科、马铃薯、油菜等轮作方式进行换茬，适时早播，浅播，土壤过湿的要散墒后播种，土壤过干则应采取镇压保墒等农业措施减轻受害。