（1）实行轮作：用无病菌土壤育苗或进行床土消毒。（2）科学用肥：注意增施生物有机肥和磷钾肥，减少和防止单一使用氮肥。同时要加深耕层，增加土壤的透气性。（3）药剂防治：当病害刚发生时，可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或70%敌克松可湿性粉剂800-1000倍液灌根，每10天灌，每10天灌一次，连灌两次。
芹菜根腐病主要危害根部和茎基部。被侵害部位开始产生水浸状红褐色斑，几天后变为暗褐色或黑褐色，稍凹陷，叶片变黄，由下往上发展，但叶片不脱落。主根被害腐烂或坏死，侧根少。
当病害刚发生时，可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或70%敌克松可湿性粉剂800-1000倍液灌根，每10天灌，每10天灌一次，连灌两次。
选用抗病品种、优质无菌床土育苗；配方施肥；发病初期用恶霉灵+多菌灵灌根！
芹菜根腐病主要是采取调节土壤湿度来进行防治。
根腐病：轮作倒茬，选抗病品种，抪前种子杀菌消毒，用99%噁霉灵土壤消毒。