病原真菌以在土壤中和混在种子间的菌核越冬，种子亦可带病。越冬后的菌核，在大田封垄后，在土壤温度和湿度适宜时，萌发产生子囊盘，子囊孢子为初次侵染源，可以气传，最远能传三十米。大豆扬花期病原孢子落到花上，利用花的养分萌发，在花开过以后侵染进入植株。
以菌核在土壤中、病残体内或混杂在种子中越冬，成为翌年初侵染源。越冬菌核在适宜条件下萌发，产生子囊盘，弹射出子囊孢子，子囊孢子借气流传播蔓延进行初侵染，再侵染则通过病健部接触菌丝传播蔓延，条件适官时，特别是大气和田间湿度高，菌丝迅速增殖，2〜3天后健株即发病。本菌寄主范围广，除禾本科不受侵染外，已知可侵染41科383种植物。菌核在田间土壤深度3厘米以上能正常萌发，3厘米以下不能萌发，在1~3厘米深度范围内，随着深度的增加菌核萌发的数量递减。