感病黄芪地上部枝叶发黄，植株萎蔫枯死。地下部主根顶端或侧根首先罹病，然后渐渐向上蔓延。受害根部表面粗糙，呈水渍状腐烂，其肉质部红褐色。严重时，整个根系发黑溃烂。极易从土中拔起。土壤湿度较大时，在根部产生一层白毛。
叶枯病的病原菌为真菌中的一种半知菌。叶枯病的发生主要是危害黄芩的叶片，开始从叶尖端或叶边缘上向内延伸不规则分布的黑褐色病斑,迅速从叶尖向下蔓延，形成黄褐色长条形病斑，严重时全叶干枯,致使植株整片枯死。叶枯病在刚开始的时候为点片发生，如果不及时防治可蔓延至全田。
须根变褐色并腐烂，主根发生红褐色或焦褐色烂斑，病株的叶子发黄、脱落。地上部枯萎，根部完全腐烂。