最好分开，两种肥料属性不同，吸级机理不一样，易浪费。
可以适量搭配使用，或通过有机肥腐熟使用更好。
菜籽饼应作为底肥使用，而复合肥作为追肥效果更好。
菜籽饼最好先堆沤发烤过，和复合肥都能一起施果树的。
菜籽饼作为底肥用，复合肥作为追肥用效果好。
一是菜籽饼使用前最好进行发酵。虽然，发酵后的菜籽饼可能会造成某些元素的流失，但是这点流失不足以构成大的影响。对菜籽饼进行发酵如果使用传统方法，时间可能较长，会影响使用，可以购买发酵剂来进行发酵。二是在施用复合肥前，最好进行测土，对土壤进行全面了解，知道缺少哪种元素，知道土壤的质地如何。在施用过程中，要综合考虑作物和土壤情况，确定菜籽饼和复合肥的比例，一般情况下，建议菜籽饼的比例要大，复合肥的比例要小。
菜籽饼最好是先堆沤发酵后作底肥用，两种都是缓释肥。