发现中心病株后加强定点监测和大田普查。现蕾至初花期，在连阴雨来临之前喷施1～2次保护性杀菌剂，如代森锰锌（全络合态）、丙森锌、双炔酰菌胺等进行预防；田间见病后，重发区立即选用治疗性杀菌剂，如甲霜灵、烯酰吗啉·锰锌、氟吡菌胺·霜霉威等药剂喷雾防治2～4次，常发和偶发区根据监测预报选用上述药剂防治1～3次或用申嗪霉素、枯草芽孢杆菌等生物制剂防治。喷药力求均匀周到，若喷药后6小时遇雨，应及时进行补喷。注重轮换用药，适当利用有机硅助剂提高药效。
加强田间管理是关键，发现中心病株要及时喷药防治，以银法利，烯酰吗啉等药剂为主。
马铃薯晚疫病是一种检疫性病害，很难防治。栽培上主要是采取土埌和种块消毒灭菌。