在病残体或病种子上越冬，病菌借水流、暴风雨传播蔓延，从稻苗伤口或自然孔口侵入，特别是秧苗受伤或受淹后发病重。燕麦假单胞菌主要存在于种子的颖壳与果皮之间或深入种子中。有病种子播种后，病原细菌会在种子萌芽时迅速增加，并侵人幼苗，使秧苗发病。水稻在抽穗开花时若遇侵染，病菌会侵入种子，成为下一季的侵染源；病株残体亦可传病。带菌种子的调运是病害远距离传播的主要途径。
在病残体或病种子上越冬，病菌借水流、暴风雨传播蔓延，从稻苗伤口或自然孔口侵入，特别是秧苗受伤或受淹后发病重。燕麦假单胞菌主要存在于种子的颖壳与果皮之间或深入种子中。有病种子播种后，病原细菌会在种子萌芽时迅速增加，并侵人幼苗，使秧苗发病。水稻在抽穗开花时若遇侵染，病菌会侵入种子，成为下一季的侵染源；病株残体亦可传病。带菌种子的调运是病害远距离传播的主要途径。