水稻空秕粒出现现象时，可能的原因一是抽穗前雌雄性器官发育不全，不能完成受精过程，以致形成空壳。二是抽穗扬花时，雌雄性器官不能协调，不能受粉而形成空壳。形成秕粒的内因主要是由于穗部谷粒营养供应不良，致使子房或胚乳中途停止发育而造成秕粒。
水稻空壳的内因，一般有两种情况：一是抽穗前雌雄性器官发育不全，不能完成受精过程，形成空壳；二是抽穗扬花时，雌雄性器官不能协调，不能受粉而形成空壳。水稻空瘪粒的外因比较复杂，有气候条件和栽培条件。开花期间，大雨或连日阴雨，湿度过大，也会影响受精和结实，形成空瘪粒。
水稻空瘪粒的主要原因多种：病虫害造成，扬花授粉期遇到不良环境影响，氮肥施用过多等多种原因。
气候因素和抽穗前雌雄器官发育不全，不能授粉形成空瘪粒。
授粉不良，气候和栽培条件，氮肥过多而迟，断水过早。
水稻产生空瘪粒的原因有温度的原因，还有施用氮肥的原因，水分管理，种子自身的原因。
水稻空秕粒可能是二化螟危害产生的，也可能是病害影响。
水稻空比秕粒的主要原因是障碍性低温冷害造成的，其次是氮肥过量施用造成贪青晚熟而形成的。