本病发生流行的适温为15—30℃、相对湿度85%以上。一般菌源数量大的连作地或栽植过密、通风透光不良的地块发病重。
大豆菌核病在阴雨连绵的年份，发生重，地势低洼和重茬地发生重。此外，施有氮肥过多，大豆生长繁茂，茎秆软弱，倒伏地段发生重，过度密植田，发病率重。
本病发生流行的适温为15-30℃、相对湿度85%以上。当旬降雨量低于40mm，相对湿度小于80%，病害流行明显减缓；旬降雨量低于20mm，相对湿度小于80%时，病斑干枯，流行终止。一般菌源数量大的连作地或栽植过密、通风透光不良的地块发病重。