玉米纹枯病常发生在春播、夏播中，玉米拔节至成熟期均可发病，主要危害玉米叶片，发病初期是从茎基部叶鞘感染，后慢慢侵染叶片，发病初期会出现水渍状灰绿色的圆形或椭圆形的病斑，由灰绿色逐渐变成白色至淡黄色，后期变为红褐色云纹斑块；湿度较大时，病斑上会出现白霉。
玉米纹枯病主要为害叶鞘，也可为害茎秆，严重时引起果穗受害。发病初期多在基部茎节叶鞘上产生暗绿色水渍状病斑，后扩展融合成不规则形或云纹状大病斑。病斑中部灰褐色，边缘深褐色，由下向上蔓延扩展。穗苞叶染病也产生同样的云纹状斑。果穗染病后秃顶，籽粒细扁或变褐腐烂。严重时根茎基部组织变为灰白色，次生根黄褐色或腐烂。多雨、高湿持续时间长时，病部长出稠密的白色菌丝体，菌丝进一步聚集成多个菌丝团，形成小菌核。