病菌以分生孢子在枝蔓表皮或幼芽鳞片内越冬，翌春幼芽萌动至开花期分生孢子侵入，形成病斑后，病部又产出分生孢子，借风雨传播，进行再侵染。人工接种，病害潜育期仅2-4天。该菌是一种兼性寄生菌，侵染决定于寄主组织的幼嫩程度和抗病力。若早春花期低温多雨，幼嫩组织(穗轴)持续时间长，木质化缓慢，植株瘦弱，病菌扩展蔓延快，随穗轴老化，病情渐趋稳定。老龄树一般较幼龄树易发病，肥料不足或氮磷配比失调者病情加重；地势低洼、通风透光差、环境郁闭时发病重。品种间抗病性存有差异。高抗品种有龙眼、玫瑰露、康拜尔早、密而紫，玫瑰香则几乎不发病。
葡萄穗轴褐枯病发病规律：该病菌以分生孢子在枝蔓表皮或幼芽鳞片及土壤中越冬。次年春天花序伸出至开花前后借风雨传播，侵染幼嫩穗轴及幼果。发病期集中在花前花后，果粒长到黄豆粒大小时则停止侵染，开花前后气温较低，如阴雨天气较多时有利于发病。地势低洼、排水不良、管理粗放、树势弱则发病重。
以分生孢子器或菌丝体在病蔓上越冬，翌年5、6月间释放分生孢子，借风雨传播，在具水滴或雨露条件下，分生孢子经4~8小时即可萌发，经伤品或由气孔侵入，引起发病。潜育期30天左右，后经1~2年才现出病症，因此本病一经发生，常连续2~3年。多雨或湿度大的地区、植株衰弱、冻害严重的葡萄园发病重。。